整理电脑同名文件的方法如下：

汇总文件

将除硬盘F以外的所有待整理文件汇总到硬盘E的一个临时文件夹中。具体操作方法可参考《如何快速整理电脑中的大量文件？》。硬盘F中的文件可以暂时不动。

删除重复文件

使用Easy Duplicate Finder等重复文件查找软件，将硬盘E和F添加到软件中，扫描出其中的重复文件并全部删除。这些软件操作简单、速度快且查重准确。

也可以使用Windows自带的“查找重复文件”功能或第三方工具如易我重复文件查找器（EaseUS DupFiles Cleaner）来查找和删除重复文件。

规划文件夹结构

用一个文本文件（如“文件分类.txt”）初步规划整理后的文件夹结构。

在硬盘E中新建一个根文件夹（如“整理后的文件夹E”），然后使用New Folder Wizard，指定该文件夹为“目标文件夹”，加载文本文件，批量创建出这些文件夹，用于存储整理后的文件。

手动清理

如果文件数量较少，可以手动查找重复文件。通过文件资源管理器，按文件名、大小、修改日期等属性进行排序，然后手动查找相同的文件并删除其中的副本。

使用专业工具

对于大量重复文件，建议使用专业的重复文件查找和清理工具，如傲梅分区助手、金舟重复文件删除工具、dupeGuru工具等。这些工具可以自动扫描硬盘，查找并清理重复文件，节省存储空间。

文件批量改名

如果需要整理大量同名文件，可以使用文件批量改名高手等工具，将相同文件名称的文件归类到不同的文件夹中。

通过以上方法，可以有效地整理电脑中的同名文件，节省存储空间，提高文件管理效率。