树莓派电脑主要运行的是 基于Linux的操作系统。其中，最常见的是 Raspbian，它是基于Debian Linux定制的，特别适合树莓派这种微型电脑。此外，还可以安装其他基于Linux的操作系统，如Ubuntu Mate、Windows 10 IoT Core、Kali Linux等，以及第三方系统如Retropie和OpenELEC等。

对于新手来说，Raspbian可能是最佳起点，因为它集成了很多工具，用于教育、编程以及其他广泛的用途，并且预装了大量有用的包。Raspbian OS是官方支持的树莓派板卡操作系统，因此许多用户都会选择它作为他们的树莓派电脑的操作系统。

综上所述，树莓派电脑主要运行的是基于Linux的操作系统，其中Raspbian是最常见的选择，但用户也可以根据个人需求选择其他基于Linux的操作系统或第三方系统。