徐志摩乘坐的飞机上仅有三个人的原因与当时的历史背景和事件细节密切相关。以下是具体分析：

邮政系统包机性质

当时徐志摩乘坐的“济南号”是邮政系统所属的飞机，属于执行邮件运输任务的包机。根据历史记录，该航班共有 两名机师和 一名乘客（即徐志摩本人）。这种包机安排通常不会搭载无关人员，因此机上人员数量较少是正常现象。

事件经过与人员构成

1931年11月19日，徐志摩为赶赴北京参加林徽因的演讲会，乘坐“济南号”从南京起飞。由于天气恶劣（大雾导致能见度极低），飞机在济南上空撞山坠毁，机上三人（两名机师、一名乘客）全部遇难。

其他说法的辨析

- 关于“本命年说”的猜测缺乏科学依据，属于民间传说；

- 有报道称徐志摩在飞行前曾欲返程，但最终仍执意登机，这一细节反映了其性格特征，但与人员数量无直接关联。

综上，飞机上仅三人的原因是邮政包机的性质决定了人员配置，而事故本身是突发且不可抗力的航空灾难。