京杭大运河在抗日战争时期确实与抗日活动有关联。具体来说，微山湖地区作为抗日战争时期的一条重要红色秘密交通线，是中共中央所在地延安至山东、华中两大战略区的“必由之路”，承担着运送物资、传递情报、护送干部等重大使命。由于微山湖地区处于华北、华中日伪军的结合部，又有津浦铁路与京杭大运河纵贯其间，因此这里敌人的据点、哨卡密布。为维护交通线的畅通，共产党领导微山湖畔各抗日武装，和敌人开展了不懈的斗争。

这条秘密交通线不仅运送了大量的物资和人员，还传递了重要的情报，为抗日战争的胜利做出了重要贡献。微山湖地区的抗日武装力量，如微湖大队、运河支队等，在抗日战争中发挥了重要作用，他们利用京杭大运河的便利条件，巧妙地与敌人周旋，保护了交通线的安全。

因此，京杭大运河在抗日战争时期不仅是军事运输的重要通道，也是抗日武装斗争的重要舞台，与抗日活动有着密切的关系。