根据你的描述，主角穿越成菜月昴的后宫小说是《[综]拯救人理之后我变成了菜月昴》。以下是相关信息的综合说明：
核心设定 主角因玩了3年的FGO号游戏，意外穿越成《从零开始的异世界生活》中的菜月昴，但与原版不同，他拥有女性身体并更换了性格。穿越后，他经历了多次身份转换，最终成为原版剧情中的菜月昴，并展开新的冒险。
后宫元素
小说中，主角与多位角色发展出情感纠葛，包括：
爱蜜莉雅： 原版角色，性格强势且对主角有重要影响； 银发半精灵美少年
其他角色：如嫉妒魔女莎缇拉等，均与主角有关键情节关联。
其他相关作品
《re：从零开始的异世界百科-一昴的穿越》是官方同人小说，但未涉及后宫元素；
《来自异世界的幸福》虽以菜月昴为主角，但设定为男性向，与后宫无关。
综上，符合“穿越成菜月昴的后宫小说”描述的作品为《[综]拯救人理之后我变成了菜月昴》。
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