《穿越西元3000后》单行本主要讲述了以下内容：

一、穿越设定与初始冒险

主角叶冰瑶是西元2011年的少女，与好友卫小桔露营时，因好奇心驱使进入一个闪烁绿光的神秘山洞。

在山洞中，她因触碰机关失去意识，醒来后发现自己穿越到了一个未知的公元3000多年世界，且处于被控制状态，面临被解剖的危机。

二、危机化解与身份谜团

幸得神秘帅哥博士离博士（葳斯基）干预，脱离控制。离博士以调查叶冰瑶身份为由，暂时救下了她。

叶冰瑶逐渐发现，自己穿越后与地球联军上将之一方有重要关联，但具体身份和使命仍充满谜团。

三、主线剧情发展

战争背景

穿越后，地球与火星爆发战争，叶冰瑶因体内神秘力量被卷入其中，逐渐了解到自己可能是火星文明的后裔。

情感线

叶冰瑶与地球联军上将之一方（如副将）建立深厚感情，双方共同经历了战争与生死考验，感情逐渐升温。

成长与觉醒

在战斗与情感经历中，叶冰瑶不断觉醒体内力量，最终成长为能够独当一面的战士，为地球联军贡献力量。

四、结局走向

叶冰瑶与副将共同面对战争结局，故事暗示了和平的可能性，但具体细节未明确说明。

补充说明

该作品融合了穿越、科幻、战争等元素，女主形象兼具坚韧与成长弧线，但部分剧情被读者认为存在玛丽苏倾向。