自制嵌入式电脑涉及多个步骤，包括硬件设计、PCB绘制、元器件焊接、引导加载程序（Bootstrap）、内核配置以及根文件系统的制作和烧写。以下是一个大致的指南：

硬件选择

选择一个适合的ARM处理器，例如AT91SAM9N12，它内置了内存管理单元（MMU）并且价格相对便宜。

由于BGA封装法的限制，可能需要使用多层PCB（至少4层）来容纳处理器和内存。

考虑添加其他必要的外围设备，如存储器（如DDR2 RAM）、接口（如USB、Ethernet）和电源管理电路。

PCB设计

使用电路设计软件（如Altium Designer、Eagle PCB等）绘制PCB板，确保过孔和引线之间的焊接球足够小，以适应BGA封装的紧凑布局。

为不同的电压需求（如处理器核心电压、RAM电压、NAND电压和USB输入电压）设计相应的电源层和信号层。

元器件焊接

将ARM处理器和内存芯片焊接到PCB上，注意BGA封装的焊接需要使用回流焊箱或热印版。

确保所有连接正确无误，特别是电源和地线连接。

引导加载程序（Bootstrap）和内核配置

编写或配置Bootstrap程序，使其能够初始化硬件并加载内核。

编译和烧写内核到处理器中，确保内核配置正确，包括内存管理、外设驱动等。

根文件系统制作

创建一个根文件系统，包含操作系统所需的基本文件和应用程序。

将根文件系统烧写到非易失性存储器（如闪存）中。

系统测试和调试

上电测试，确保所有硬件组件正常工作。

使用调试工具（如串口调试器）进行系统调试，检查内核启动过程、硬件驱动和系统性能。

优化和迭代

根据测试结果进行必要的优化和调整，如电压调节、散热设计等。

迭代设计和开发过程，直到满足所有功能需求和性能指标。

请注意，自制嵌入式电脑是一个复杂的过程，涉及电子工程、计算机科学和操作系统等多个领域的知识。建议在开始之前，充分了解相关知识和技能，并参考相关的技术文档和社区资源。此外，由于技术更新迅速，建议定期查阅最新的技术动态和开发指南。